一頭好的種用牦牛，不在乎它本身生產(chǎn)性能的高低，而在于能否生產(chǎn)優(yōu)質(zhì)的后代，也就是說(shuō)是否具有優(yōu)良的遺傳型。所以，牦牛的選種，實(shí)質(zhì)上就是對(duì)牦牛遺傳型的選擇。
1、牦牛的性能測(cè)定
對(duì)于牦牛的增重、階段活重、體格大小、飼料利用率等遺傳力較高，且能夠活體測(cè)定的性狀，它是一種十分有效的選擇方法。1.5-3歲牦牛的二選和定選均采用這種方法。
在實(shí)際選種中，當(dāng)被選個(gè)體同一性狀只有一次成績(jī)記錄時(shí)，應(yīng)先校正到同一標(biāo)準(zhǔn)條件下，然后按表型順序選優(yōu)去劣。
當(dāng)被選個(gè)體同一性狀有多次成績(jī)記錄時(shí)，先把多次記錄進(jìn)行平均，然后按平均值進(jìn)行排序選種。
2、牦牛的系譜測(cè)定
系譜測(cè)定就是通過(guò)查閱和分析各代祖先的生產(chǎn)性能、發(fā)育情況以及其他材料，來(lái)估計(jì)該種畜的近似種用價(jià)值，以便基本確定種畜的去留。
在實(shí)踐中，往往是將多頭種畜的系譜直接進(jìn)行針對(duì)性的分析比較。鑒定時(shí)，重點(diǎn)放在父母代的比較上，其次是祖父母代上。因?yàn)榻H屬影響大，遠(yuǎn)親影響??；審查和鑒定不能針對(duì)某一性狀，要以生產(chǎn)性能為主做全面的比較；不同系譜要同代祖先相比，即親代與親代、祖代與祖代比較。
系譜測(cè)定多用于幼年和青年時(shí)期，本身尚無(wú)生產(chǎn)性能記錄時(shí)的選種，是早期選種的方法之一。在牦牛生產(chǎn)中主要用于種用牦牛的初選。
3、牦牛的同胞測(cè)定
同胞測(cè)定是根據(jù)其同胞的成績(jī)來(lái)評(píng)定某一個(gè)體的種用價(jià)值?？煞譃槿麥y(cè)定、半同胞測(cè)定、全同胞一半同胞混合測(cè)定等三種。
而牦牛選種中的同胞測(cè)定主要是半同胞測(cè)定，另兩種同胞測(cè)定較少應(yīng)用。
對(duì)于牦牛的產(chǎn)乳量、乳脂率、產(chǎn)后乏情長(zhǎng)短、排精量等限性性狀和屠宰率、凈肉率等活體難于準(zhǔn)確度量的性狀，用同胞測(cè)定是最好的方法之一。
